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    SNAP-ChIP ® Spike-in Controls 如何工作?

    发布时间: 2021-06-25  点击次数: 784次

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    SNAP-ChIP ®

    认证抗体

    您可以信赖的 ChIP 抗体

    抗体选择是研究人员在设计 ChIP 实验时必须做出的最重要的决定,但严格的抗体验证既昂贵又耗时。在 EpiCypher,我们认识到这一挑战,并已着手进行大量工作来分析和鉴定性能最高的 ChIP 抗体。

     

     

    SNAP-ChIP ®认证抗体使用 EpiCypher 专有的SNAP-ChIP ®掺入 技术进行测试,提供针对特定核小体底物的强大应用内抗体验证。这种严格的测试可确保在您的 ChIP 实验中发挥可靠的性能。

     

    低交叉反应性知识产权效率高广泛的批量测试定期添加新抗体

     

    SNAP-ChIP ® Spike-in Controls 如何工作?

    SNAP-ChIP 掺入是 DNA 条形码重组核小体的集合,可直接添加到 ChIP 实验中以评估抗体特异性和效率。

     

    IP 之前,spike-ins 被添加到标准的 ChIP 工作流程中。PTM 特异性 DNA 条形码的回收率由 qPCR 或下一代测序确定,揭示脱靶相互作用和富集(与掺入的输入染色质)。

    SNAP-ChIP:使用核小体鉴定 ChIP 抗体的平台

    抗体特异性

    SNAP-ChIP ®认证抗体经过特异性(即交叉反应性;左 y 轴)和富集(即回收率、效率;右 y 轴)测试,SNAP-ChIP 认证抗体与相关抗体的交叉反应性低于 20% PTM(蓝色条)并从输入染色质(绿色条)中恢复至少 5% 的目标 PTM

     

    不符合这些标准的抗体(参见“失败”图)不适合 ChIP-seq,使用时应格外小心,因为它们可能会导致不正确的生物学解释。

    为什么核小体环境很重要?

    使用 SNAP-ChIP 掺入对照,我们发现:

     

    常用的组蛋白 PTM 肽阵列不能预测 ChIP 中的抗体性能(Shah et al. Mol. Cel 2018)。

    许多被高度引用的抗体与相关标记发生交叉反应,导致错误的生物学解释( Shah et al. 2018 and Lam et al. 2019)。

    生产批次之间的抗体特异性可能会有很大差异(请参阅我们的博客)。

    SNAP-ChIP ® Spike-In 控制面板

    ChIP 定义的对照。我们提供各种组蛋白 PTM 的面板,包括赖氨酸甲基化和酰化。

     

    SNAP-ChIP ®认证抗体

    这些抗体已经使用 SNAP-ChIP 掺入进行了验证,并具有特异性和目标富集。

     

    SNAP-ChIP ®验证服务

    让专家帮忙!借助 SNAP-ChIP 验证服务,EpiCypher 将帮助您找到适合您的 ChIP-seq 研究的抗体。

     

     

    用于 CUT&RUN CUT&Tag CUTANA™ 检测

    高性能基因组作图分析

    用于 CUT&RUN CUT&Tag CUTANA™ 检测 利用免疫束缚技术的最新进展提供高效、超灵敏的染色质定位能力。与表观基因组分析的标准检测方法 ChIP-seq 相比,这两项激动人心的新技术具有明显的优势,包括:

     

    需要更少的细胞每个样本只需要 3-5 百万个测序读数改进的信噪比显着节省时间和成本

     

    超低输入染色质作图分析

    CUTANA™ CUT&Tag 检测基于免疫束缚技术的最新进展,提供创新的工作流程,使用 < 5,000 个细胞对组蛋白 PTM 进行分析。

     

    CUT&Tag 是一项新兴技术,其协议正在积极开发中,包括单细胞工作流程。当使用 < 5,000 个细胞核或细胞分析组蛋白 PTM 时,这种方法是理想的。对于大多数实验,EpiCypher 强烈建议使用我们强大的 CUTANA™ CUT&RUN 检测,该检测兼容 5,000 500,000 个细胞,并针对各种靶标、样品输入、固定条件进行了优化。

     

    * 不建议将 CUT&Tag 用于染色质相关蛋白 请改用 CUTANA CUT&RUN 检测。

     

    CUT&Tag 是如何工作的?

    Ç leavage ünDer Ť具体目标和标记心理状态(CUT&标记)是一种新型的immunotethering测定中,基于切割下目标和推出使用核酸酶(CUTRUN)方法。

     

    CUT&Tag 中,蛋白 A、蛋白 G Tn5 转座酶的融合用于催化抗体结合染色质上的同步切割和测序接头连接。在 CUT&Tag 中使用 Tn5 是一个关键的进步,因为这一步骤消除了染色质碎裂和文库制备的需要。

     

    ChIP-seq 分析相比,CUT&Tag 分析显示出显着改善的信噪比 (S/N),特别是用于在超低样本输入中映射组蛋白 PTM

     

     

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