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lexogen
产品时间:2020-04-14
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quantseq_mainimage  lexogen

QuantSeq 3'mRNA-Seq文库制备试剂盒,用于Illumina

在QuantSeq文库制备过程中节省成本并简化了球蛋白mRNA的消耗

全基因组基因表达分析

具有成本效益的微阵列和标准RNA-Seq替代品

总RNA输入低100 pg

适用于低质量和FFPE样品

在Bluebee的免费数据分析管道®基因组学分析平台

单读数测序,多达9,216个样品/泳道

提供双重索引和唯yi分子标识符(UMI)

QuantSeq 3'mRNA-Seq文库制备试剂盒,用于Illumina

QuantSeq FWD试剂盒是一种文库制备方案,旨在生成与聚腺苷酸化RNA的3'末端接近的Illumina兼容文库。

QuantSeq FWD在第二条链合成引物中包含Illumina Read 1接头序列,因此朝poly(A)尾部生成NGS读数,直接反映了mRNA序列(请参见工作流程)。此版本是基因表达分析的推荐标准。Lexogen进一步提供了具有可选双索引(i5和i7索引)的高通量版本,允许在一个通道中多路复用多达9,216个样本。

 

低投入低质量样品分析

总RNA的所需输入量低100pg。QuantSeq适合从低质量的RNA(包括FFPE样品)可重复生成文库。相同样品的两种不同RNA品质(FFPE和新鲜冷冻冷冻块)的比较

QuantSeq文库制备过程中耗尽球蛋白mRNA

新! 用于QuantSeq的Globin块模块可从全血中仅50 ng的总RNA中生成缺失珠蛋白的,易于测序的3'mRNA-Seq文库。无需其他协议步骤。该模块中的RS-Globin Block解决方案仅取代了QuantSeq试剂盒中的标准RNA去除解决方案。使用Globin Block进行QuantSeq,可将映射到球蛋白mRNA的读图从50%到80%降低到5%(图4),并且基因检测显着增加(图5)。

*对于附图:输入RNA(50 ng或250 ng)的提取方法如下:1个 SPLIT RNA提取试剂盒,2个其他试剂盒(包括红细胞裂解液)或3个其他试剂盒没有红细胞裂解液

 

快速周转

QuantSeq的简单工作流程允许仅在4.5小时内(包括不到2小时的动手时间)生成即可测序的NGS库。

基因表达定量的直接计数

每个转录本仅产生一个片段;因此,不需要长度标准化。这样可以更准确地确定基因表达值,并使QuantSeq成为基因表达研究中微阵列和常规RNA-Seq的佳替代品。

 

简单的生物信息学分析

通过跳过结检测,可以简化读取映射。在转录物的3'末端几乎没有连接处产生读数。因此可以加速数据处理。

 

QuantSeq数据分析管道还集成在Bluebee基因组学分析平台上,即使没有生物信息学背景,任何用户也可以使用。访问代码包含在QuantSeq套件中。可以在网上商店购买其他代码。促销:直到2019年12月31日,免费提供高达1.5 GB输入的附加代码。

 

高链特异性

QuantSeq保持> 99.9%的异常链特异性,并允许将读数映射到基因组上的相应链,从而能够发现和定量反义转录本和重叠基因。

 

节省成本的复用

QuantSeq库旨在用于高度复用。单个索引套件(目录号015)中多包括96个i7索引。还可以使用Lexogen i5 6 nt双索引附加组件(目录号047或015.384)引入其他i5索引。一起使用,Lexogen的96 i7和96 i5 6 nt索引可为测序提供多达9,216种不同的索引组合。

 

新!QuantSeq 3'mRNA-Seq文库制备物现在也可提供多达384种预混合的独特双索引(目录号113、114、115)。Lexogen的新型12 nt UDI具有出色的纠错功能,可大程度地输出测序数据,也可作为独立的附加套件(目录号107 – 111)与其他文库制备工具一起使用。

 

这种高水平的多路复用可以节省成本,因为QuantSeq中的长度限制可以节省测序空间。QuantSeq还设计用于产生短测序读段(SR50,SR100)的插入片段大小。

 

北京华新康信生物科技有限公司专注于生命科学领域,由丰富从业经验的技术团队和管理团队组建而成,主营生物化学试剂,仪器,实验耗材等。

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